Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
D13Ertd608eQ3UPR8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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