Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nkx6-3Q3UHX8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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