Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx27Q3UHD6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx27Q3UHD6 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms