Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Lrrc58Q3UGP9 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lrrc58Q3UGP9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Lrrc58Q3UGP9 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lrrc58Q3UGP9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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