Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nom1Q3UFM5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms