Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm3715-201ENSMUST00000172308 617 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtpbp6Q3U6U5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms