Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q3U6N9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms