Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem35bQ3U0Y2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms