Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V1

Khsrp, Far upstream element-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KhsrpQ3U0V1 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KhsrpQ3U0V1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KhsrpQ3U0V1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms