Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Palb2Q3U0P1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Palb2Q3U0P1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms