Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Srsf6Q3TWW8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Srsf6Q3TWW8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms