Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc102aQ3TMW1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc102aQ3TMW1 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms