Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trappc10Q3TLI0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms