Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdlim7Q3TJD7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms