Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp39Q3TIX9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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