Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Rpusd3Q14AI6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rpusd3Q14AI6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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