Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Lingo4Q149C3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lingo4Q149C3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms