Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rundc1Q0VDN7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms