Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Vps8Q0P5W1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vps8Q0P5W1 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms