Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Spata18Q0P557 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms