Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MitfQ08874 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms