Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
MestQ07646 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
MestQ07646 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
MestQ07646 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
MestQ07646 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms