Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Cdx4Q07424 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms