Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Prrx2Q06348 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms