Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sox12Q04890 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms