Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Crisp3Q03402 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms