Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Msx2Q03358 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms