Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
RykQ01887 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
RykQ01887 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RykQ01887 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
RykQ01887 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RykQ01887 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RykQ01887 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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