Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VcpQ01853 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VcpQ01853 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms