Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gbp1Q01514 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms