Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec23aQ01405 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sec23aQ01405 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms