Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top2aQ01320 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top2aQ01320 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms