Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EgfrQ01279 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EgfrQ01279 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms