Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
SeleQ00690 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms