Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Itga4Q00651 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Itga4Q00651 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms