Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pax8Q00288 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms