Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Pitx2P97474 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Pitx2P97474 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms