Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf1bP97358 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Taf1bP97358 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms