Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pkp1P97350 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms