Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Irx3P81067 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Irx3P81067 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms