Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cct7P80313 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cct7P80313 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms