Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rad50P70388 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms