Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pkn1P70268 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms