Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NfixP70257 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NfixP70257 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms