Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hoxd13P70217 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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Hoxd13P70217 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Hoxd13P70217 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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