Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Traf5P70191 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Traf5P70191 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms