Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Rps29P62274 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms