Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp46P62069 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp46P62069 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms