Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Setd4P58467 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Setd4P58467 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms