Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp25P57080 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms